能源與動力工程學院前身為南京電力高等專科學校動力工程系，辦學歷史可以追溯到1946年蘇州高級工業職業學校創建（簡稱“蘇高工”）。曾擁有電廠熱能動力裝置、熱能與動力工程、熱工儀表與自動化、熱能動力設備與應用等多個電力生產與能源動力類專業。2000年南京電力高等專科學校與南京機械專科學校合并組建而成南京工程學院，2001年原核工業部直屬南京工業學校并入南京工程學院。2006年原動力工程系更名為能源與動力工程學院。學院現設置能源與動力工程（含火電廠集控運行、生產過程自動化、制冷與空調工程3個專業方向）、建筑環境與能源應用工程、核工程與核技術和新能源科學與工程4個本科專業，在校本科生人數1700多人。
目前全院在職教職工78人，其中教師74人，其中教授（教授級高工）9人，副教授（高級工程師）21人。教師中具有博士學位31人，碩士學位31人。教師中有江蘇省“青藍工程”、江蘇省“333工程”培養對象、江蘇省有特殊貢獻中青年專家、政府特殊津貼專家、中國電力企業聯合委員會“跨世紀人才”、南京市321人才等10多人。學院下設兩個辦公室和四個教研室，即學院綜合辦公室、學生工作辦公室、熱動教研室、集控教研室、暖通教研室和核電教研室。
動力工程及工程熱物理學科是江蘇省級重點建設一級學科，熱能工程是江蘇省級重點建設二級學科，學科團隊曾榮獲江蘇省普通高校優秀學科梯隊稱號。熱能與動力工程專業是國家級特色專業、全國首批卓越工程師教育培養計劃試點專業、江蘇省高校特色專業、江蘇省能源動力類重點核心專業。學院榮獲教育科學“十一五”規劃課題優秀成果獎、江蘇省高等教育教學成果一、二等獎等榮譽稱號。學院擁有能源與動力工程實驗教學示范中心，熱流科學實驗室、鍋爐實驗室、汽輪機實驗室、熱工控制實驗室、DCS實訓室、施耐德電氣校企合作實驗室、電力仿真控制實驗室、暖通空調實驗室等10多實驗室。
近年來，學院教師承擔國家級、省部級科研項目10多項，校企合作橫向科研項目200多項。發表科研論文200多篇，部分科研成果推廣應用產生了較好的經濟效益和社會效益。
經過60多年的辦學歷程，學院在學科建設、科學研究、辦學規模、教學水平和育人環境等方面都得到了顯著的提高。學院立足行業、面向電力能源企業、服務生產一線，培養基礎扎實、知識面寬、實踐能力強、綜合素質高、具有創新精神的應用型工程技術專門人才，為國家和地方經濟建設做出更大的貢獻。