山東大學生命科學學院導師：申玉龍 正文

　　申玉龍Yulong Shen，博士，教授, 博士生導師
　　
　　通訊地址: 山東大學微生物技術國家重點實驗室微生物樓526室
　　山東省濟南市山大南路27號，郵編250100
　　Tel：0531-88362928，Tel/Fax 0531-88362928
　　yulgshen＠sdu.edu.cn
　　
　　教育背景:
　　1982至1989年于蘭州大學生物系學習并獲得碩士學位。1993至1996年就讀于英國伯明翰大學生物系，獲得細胞與分子生物學方向理學博士學位。1997-1999被聘為日本學術學術振興會博士后(STA fellowship)。1999至2003, 作為研究員任職于日本產業技術綜合研究所。2003年11月至今, 受聘于山東大學微生物技術國家重點實驗室。多年來一直從事古菌生物化學和分子生物學的研究工作，主要致力于古菌DNA重組修復與基因組穩定性維持機制以及極端環境微生物資源研究。在J. Biol. Chem., Nucleic Acids Res., J. Bacteriol. , DNA Repair和Appl. Environ. Microbiol. 等相關國際期刊發表學術論文近30篇。與國際相關領域研究室保持密切合作關系，多次應邀赴美國、德國、丹麥、英國、意大利、澳大利亞和日本等國家參加學術會議并進行學術訪問和交流。
　　
　　研究方向
　　主要開展以下兩方面的研究：
　　1. 極端嗜熱古菌復制、重組及修復機制研究。以嗜熱古菌為材料，利用分子生物學、生物化學、遺傳學和結構生物學等手段，研究重要蛋白質的性質、相互作用、結構和體內外功能，揭示古菌DNA重組修復的機理；
　　2. 資源環境微生物學研究。從極端環境如高溫、酸性和堿性或其它特殊環境中分離、鑒定微生物，鑒定生物質降解相關的酶類；研究酶的性質、結構與功能，利用分子生物學方法改造酶，為極端環境微生物和極端酶的工業應用奠定基礎。
　　
　　研究課題
　　1. 已主持或參與完成多項國家級研究項目，包括國家自然科學基金面上項目和國家重點基礎研究發展計劃（973）項目。
　　2. 目前承擔國家自然科學基金重點項目一項及面上項目兩項。
　　
　　主講課程
　　極端環境微生物學及其專題講座
　　
　　招生情況
　　招生專業: 生物化學與分子生物學、微生物學
　　每年招收碩士、博士研究生數名。另外接收博士后若干名。
　　
　　聯合培養情況及畢業生去向
　　與國內外研究室保持著合作關系，優秀學生可被選派到相關研究組聯合培養或深造。畢業生去向有：國內大專院校教師、國內生物技術公司職員及國外博士生或博士后等。
　　
　　發表論文：
　　1. Hong Y, Chu M, Li Y, Ni J, Sheng D, Hou G, She Q, Shen Y*. (2011) Dissection of the functional domains of an archaeal Holliday junction helicase, DNA Repair, doi:10.1016/j.dnarep.2011. 10.009
　　2. Zheng T, Huang H, Zhang C, Ni J, She Q, Shen Y*. (2011) Development of simvastatin selection marker for hyperthermophilic acidophile, Appl. Environ. Microbiol., doi:10.1128/AEM.06095 -11
　　3. Wei T., Zhang S., Hou L., Ni, J., Sheng D., Hou G., Shen Y*. (2011) The carboxyl terminal of the archeal nuclease NurA is involved in the interaction with single-stranded DNA-binding protein and dimer formation. Extremophiles, 15：11-18.
　　4. Ma X., Hong Y., Han W., Sheng D. Ni, J. Hou G., Shen Y*. (2010) Single-stranded DNA binding activity of XPBI, but not XPBII, from Sulfolobus tokodaii causes double-stranded DNA melting, Extremophiles，14：1-10.
　　5. Wu L., Liu B., Hong Y., Sheng D., Shen Y*., Ni J. (2010) Residue Tyr224 is critical for the thermostability of Geobacillus sp. RD-2 lipase, Biotechnol Lett. 32:107-112.
　　6. Liu B., Wu L., Liu T., Hong Y., Shen Y*., Ni J. (2009) A MOFRL family glycerate kinase from the thermophilic crenarchaeon Sulfolobus tokodaii with unique enzymatic properties, Biotechnol Lett. 31:1937-1941.
　　7. Wang F, Zhang S. Huang Q, Shen Y* and Ni J. (2009) Advance in genetic manipulation systems of Hyperthermophilic archaea Acta Microbiologica Sinica 49, 1418-1423.
　　8. Huang Q, Shen Y and Ni, J. Optimization of selectivr conditions for the selection of uracil auxotrophs of thermophilic archaea Sulfolobus tokodaii. (2008) Journal of Shandong University (Natural Science), 43: 6-10.
　　9. Liu T, Shen Y, Liu Q, Liu B (2008) The unique Entner-Doudoroff (ED) glycolysis pathway of glucose in archaea--a review. Acta Microbiologica Sinica. 48:1126-31
　　10. Lu S, Li Z, Wang Z, Ma X, Sheng D, Ni J, Shen Y*. （2008）Spatial subunit distribution and in vitro functions of the novel trimeric PCNA complex from Sulfolobus tokodaii. Biochem Biophys Res Commun. 376:369-74.
　　11. Li Z., Lu S., Hou G., Ma X., Sheng D., Ni J., and Shen Y*. (2008) Hjm/Hel308a DNA helicase from Sulfolobus tokodaii promotes replication fork regression and interacts with Hjc endonuclease in vitro. J. Bacteriol. 190: 3006–3017.
　　12. Zhang S., Wei W., Hou G., Zhang C., Liang P., Ni J., Sheng D., and Shen Y*. (2008) Archaeal DNA helicase HerA interacts with Mre11 homologue and unwinds blunt-ended double-stranded DNA and recombination intermediates. DNA Repair 7:380–391.
　　13. Wei T., Zhang S., Zhu S., Sheng D., Ni J., and Shen Y*. (2008) Physical and functional interaction between archaeal single-stranded DNA-binding protein and the 5'-3' nuclease NurA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 367:523-9.
　　14. Sheng D., Li M., Jiao J., Ni J., and Shen Y*.（2008）Co-expression with RadA and the characterization of stRad55B, a RadA paralog from the hyperthermophilic crenarchaea Sulfolobus tokodaii. Sci. China C Life Sci. 51:60-5.
　　15. Sheng D., Zhu S., Wei T., Ni J., and Shen Y*. (2008) The in vitro activity of a Rad55 homologue from Sulfolobus tokodaii, a candidate mediator in RadA-catalyzed homologous recombination. Extremophiles 12:147-157.
　　16. Sheng D., Zhu S., Li M., Jiao, Ni J., and Shen Y*. (2008) Cloning, expression and radiation inducibility of RadA from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii. Acta Microbiologica Sinica 48:1-6.
　　17. Hong Y., Wu L., Liu B., Peng C., Sheng D., Ni J, and Shen Y*. (2008) Characterization of a glucan phosphorylase from the thermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii strain 7. J. Mol. Catal. B: Enzy. 54:27-34
　　18. Liu B., Hong Y., Wu L., Li Z., Ni J., Sheng D., and Shen Y*. (2007) A unique highly thermostable 2-phosphoglycerate forming glycerate kinase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii: gene cloning, expression and characterization. Extremophiles. 11:733-9.
　　19. Liu B., Li Z., Hong Y., Ni J., Sheng D., and Shen Y*. ( 2006) Cloning, expression and characterization of a thermostable exo-beta-D-glucosaminidase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii. Biotechnol. Lett. 28:1655-1660.
　　20. Liu B., Ni J., and Shen Y*. (2006) Cloning expression and biochemical characterization of a novel diacetylchitobiose deacetylase from the hyperthermophilic archaeion Pyrococcus horikoshii. Acta Microbiologica Sinica 46:255-258.
　　21. Tang X.-F, Shen Y., Matsui E., Matsui I. (2004) Domain topology of the DNA polymerase D complex from a hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii. Biochemistry. 43:11818-27.
　　22. Shen Y., Tang X.-F., Matsui E., and Matsui I. (2004) Subunit interaction and regulation of activity through terminal domains of the family D DNA polymerse from Pyrococcus horikoshii. Biochem. Soc. Trans. 32:245-9.
　　23. Shen Y., Tang X.-F., Yokoyama H., Matsui E., and Matsui I. (2004) A 21-aa peptide from the cysteine cluster II of the family D DNA polymerase from Pyrococcus horikoshii stimulates its nuclease activity which is Mre11-like and prefers manganese ion as the co-factor. Nucl. Acids Res. 32: 158-68.
　　24. Shen Y., Tang X.-F., and Matsui I. (2003) Subunit interaction and regulation of activity through terminal domains of the family D DNA polymerase from Pyrococcus horikoshii. J. Biol. Chem. 278:21247-57.
　　25. Shen Y., Musti K., Hiramoto M., Kikuchi H., Kawabayashi Y., and Matsui, I. (2001) Invariant Asp1122 and Asp1124 are essential residues for polymerization catalysis of family D DNA polymerase from Pyrococcus horikoshii. J. Biol. Chem. 276: 27376-83.
　　26. Zheng R., Matsui E., Shen Y., Kishnasastry M., Feng Y., Darnis S., Kawarabayasi Y., Kikuchi H., Harata K., and Matsui I. (2001) The novel function of a short region K 253 XRXXXD 259 conserved in the exonuclease domain of hyperthermostable DNA polymerase I from Pyrococcus horikoshii. Extremophiles 5:111-7.
　　27. Shen Y., Newbury H. J., and Ford-Lloyd B. V. (1998) Identification of taxa in the genus Beta using ITS1 sequence information. Plant Mol. Biol. Rep. 16: 147-55.
　　28. Shen Y., Ford-Lloyd B. V., and Newbury H. J. (1998) Genetic relationship using both PCR-based and DNA sequencing methods. Heredity 80: 624-32.
　　29. Shen Y., Newbury H. J., and Ford-Lloyd B. V. (1996) The taxonomic characterization of annual Beta germplasm in a genetic resources collection using RAPD makers. Euphytica 91: 205-12.

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