研究所實行科學和學術理事會領導下的所長負責制。理事會成員包括了抗體和生物研究領域先驅者、諾貝爾獎得主、中國科學院院士在內的多位世界知名科學家。研究所通過引進資深特聘研究員高起點、快速啟動和推進前沿科研項目，引進尖端核心技術，積極招募國內外高水平生物技術人才。研究所現已建立免疫化學、細胞生物學、計算生物和結構生化四個研究方向，擁有高通量篩選平臺、分析化學平臺、生物醫學大數據平臺和抗體篩選平臺這四大技術支撐平臺。核心實驗室包括抗體設計學、抗體化學、表觀篩選學、結構生物化學、細胞生物學、干細胞生物學、抗體工程學、抗體結構學、計算生物學、生物工程學、再生醫學與神經修復實驗室及蛋白質機器與新藥實驗室等。在此基礎上，研究所也為青年學者們設立了針對當前科研的前沿熱點的獨立實驗室，如已經啟動的T細胞工程實驗室。

我們的發展策略是以核心實驗室為單位開展多個方向的前沿基礎研究，充分發揮各自的優勢，針對生命科學領域的關鍵問題形成有特色的解決方案，產生突破性發現和顛覆性技術，實現各自科研上點的突破；同時核心實驗室之間的科研交叉融合，協同促進和發展，打造整合型生物醫學研究平臺，形成有國際影響力的現代化研究所；在深入探索生命的本質的同時，精確把握國際科研發展的大趨勢，鼓勵和嘗試科研產業化和技術變現的有效途徑，不斷推陳出新，成為充滿活力可持續的現代化研究所。

免疫化學研究所的研究團隊及平臺，可以實現一個新型重要抗體從發現，到經過所有必要程序，到最終轉變為藥物的研發過程。研究所已逐漸形成具有自主知識產權的治療性抗體研發與產業化能力，并加強國際合作，為海內外相關企業提供技術支持與服務。同時，研究所也將為研究者提供卓越的教育以面對未來的科研挑戰。

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